Sylabus přednášek z BIOLOGIE A GENETIKY
(FVHE, FVL, magisterské studijní programy (zimní semestr 2009/2010)
Návody na cvičení:
Návod na cvičení č. 2
Návod na cvičení č. 7
Návod na cvičení č. 8
Návod na cvičení č. 9
- Úvod do studia biologie. Obecná, molekulární a buněčná biologie. Podstata života, obecné charakteristiky a organizovanost živých soustav, hierarchické systémy. Dějiny biologie, J.E. Purkyně. Biologie na počátku 21. století, vývojové trendy.
- Buněčná teorie, buňka jako systém, tok látek, energie, informace. Buňky prokaryotní a eukaryotní. Buněčné struktury. Evoluce eukaryontních buněk (endosymbiotická teorie). Nebuněčné formy života.
- Chemické složení živých soustav. Hypotézy o vzniku života a buňky, replikativní ribozymový hypercyklus. Období oxidu uhličitého, metanu, kyslíku. Prvkové a látkové složení bioplazmy, voda, biopolymery (proteiny, nukleové kyseliny, polysacharidy, lipidy). Proteomika.
- Energie, katalýza, biosyntéza. Získávání energie buňkou, fotosyntéza, respirace. Aktivované nosičové molekuly. Katabolismus. Princip získávání energie v mitochondriích a chloroplastech, chemiosmostická spřažení.
- Paměťový systém buňky, genetická informace. Gen strukturní, geny pro rRNA, tRNA, negenové oblasti DNA. Genom, genofory, plazmidy, chromozomy eukaryotické, prokyryotické (mitochondriální, chloroplastové, jaderné). Exprese genetické informace. Transkripce, translace. Posttranskripční úpravy.
- Posttranslační modifikace proteinů. Ubikvitinace. Regulace genové exprese. RNA-silencing, siRNA. Replikace genetické informace. Oprava chyb na DNA. Transpozice, transpozony, (prokaryota, eukaryota - retroelementy), repetitivní DNA.
- Metody molekulární biologie: izolace DNA; enyzmy v molekulární biologii; amplifikace úseků DNA pomocí PCR – princip a využití; restrikční analýzy. Separační metody: gelová elektroforéza. Sekvenování – princip a aplikace. Základní metody analýzy proteomu.
- Membránový systém buňky. Lipidová dvojná vrstva. Syntéza membrán. Membránové proteiny. Zesílení plazmatické membrány. Vnější ochrana buněk. Přenos látek přes membrány. Pasivní transport, aktivní transport. Transportní membránové proteiny. Vnitrobuněčné oddíly a vezikulární transport. Endocytóza, pinocytóza, fagocytóza. Lyzosomy
- Cytoskeletální princip buňky. Cytoskelet. Střední (intermediární) filamenta. Mikrotubuly. Centrosom. Aktinová vlákna. Molekulové motory (kinesiny, dyneiny, myosiny). Pohyb buněk závislý na aktinu, svalové stahy. Cytoskelet u bakterií.
- Buněčná signalizace. Formy signálu. Typy extracelulárních signálů (hormony, cytokiny, neurotransmitery). Vnitrobuněčná signální kaskáda (obecně). Typy receptorů na povrchu buňky a intracelulární signální dráhy. Receptory spojené s G-proteiny, receptory spojené s enzymy. Ras protein.
- Buněčný cyklus. Fáze buněčného cyklu. Mitoza, meioza, cytokineze. Regulace buněčného cyklu. Cykliny, cyklin-dependentní kinázy. Zastavení buněčného cyklu, buněčné stárnutí. Regulace počtu buněk v mnohobuněčném organismu. Typy programované buněčné smrti. Apoptóza, nekróza buňky. Diferenciace buněk, genová regulace ontogeneze.
- Využití molekulární biologie v praxi na příkladu - antibiotika, mechanismy účinku a rezistence bakterií proti těmto účinkům. Antibiotika působící na buněčnou stěnu, antibiotika inhibující syntézu prekurzorů RNA/DNA, inhibice syntézy RNA/DNA, inhibice proteosyntézy, narušení funkce plazmatické membrány. Mechanismy antibiotické rezistence. Horizontální přenos genetické informace u bakterií.
Zvýrazněná výuka je spolufinancována Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky
Sylabus cvičení z Biologie a genetika
I. ročník (FVL, FVHE, magisterské studijní programy) - zimní semestrTýden | Náplň cvičení | Počet hodin |
1. | Úvod, mikroskopická technika I - organizace cvičení, vedení pracovního protokolu - světelné mikroskopy a jejich složení, zásady mikroskopování - suché objektivy, zastavení objektu v zorném poli, - rozlišovací schopnost objektivů, |
2 |
2. | Mikroskopická technika II, trvalý preparát - středění objektu, funkce kondenzoru a clony - krevní nátěr a barvení - měření mikroskopických objektů MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE I informace k cvičení z molekulární biologie II a III |
2 |
3. | Mikroskopická technika III, nativní preparát - optické roviny a měření výšky objektu - nativní preparát a barvení - pozorování ve fázovém kontrastu |
2 |
4. | Chemické složení bioplazmy - průkaz bílkovin, tuků, DNA, vody, škrobu, enzymová aktivita amylázy |
2 |
5. | Nebuněčné formy života, elektronové mikroskopy - viry a elektronové mikroskopy - 1. test z buněčné biologie |
2 |
6. | Eukaryota - živočišná buňka - tvar buněk, tvar a počet jader, buněčné organely, buněčné inkluze |
2 |
7. | Eukaryota - rostlinná buňka - buněčná stěna, chloroplasty, vakuoly, krystalické inkluze MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE II příprava tkáně k izolaci DNA |
2 |
8. | MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE III izolace DNA, příprava PCR, vlastní provedení PCR |
2 |
9. | MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE IV restrikční reakce s PCR produktem, elektroforéza DNA, vizualizace a hodnocení PCR produktu, ukázka sekvenace DNA |
2 |
10 | Prokaryota - roztěr bakterií a barvení - otiskový preparát - pozorování pod imerzí - sinice |
2 |
11. | Metody studia biologie - buněčné kultury, práce s inverzním mikroskopem - modelový organismus Drosophila melanogaster - 2. test z buněčné biologie |
2 |
12. | Udělení Zápočtu | 2 |
Zvýrazněná výuka je spolufinancována Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky
Návody na cvičení:
Návod na cvičení č. 2
Návod na cvičení č. 7
Návod na cvičení č. 8
Návod na cvičení č. 9